Le musée de l'EAU est situé dans le village Bonjo du canton Wouri-Bwele, arrondissement de Yabassi, département du Nkam, région du Littoral. Son lieu d'implantation est la rive droite du Wouri en face du débarcadère de Bonakwaba-Bonio (île Wouri).
A partir de Douala, capitale économique du Cameroun, deux itinéraires sont possibles pour se rendre au Musée :
- Par voie routière (itinéraire conseillé en bleu) : Bonabéri-Békoko-Souza-Carrefour Kaké – Miang – Mangamba – Bona'Anja – Siga Bonjo (50 Km environ)
- Voie fluviale (en noir) : Bonamouang (Akwa Nord) – Bonjo (20 Km)
